Kilpikonnat ninjat elävät kaupungin viemäriverkossa ja tulevat usein pinnalle auttamaan ihmisiä taistelemaan eri pahoja voimia vastaan. Tänään Game Heist Half Shellissä he joutuvat tunkeutumaan rakennukseen, jonka robotit tarttivat. Auta heitä tässä. Valitse pelin alussa haluamasi merkki. Muista, että jokaisella sankarillamme on vain hänen taistelutaitoaan. Sitten näet kuinka hän tuli rakennukseen. Nyt sinun täytyy käydä läpi käytävät ja huoneet ja tuhota kaikki viholliset, joita tavataan. Myös tapa kerätä erilaisia kohteita ja pizzaa, joka sijaitsee eri paikoissa.