Maagisessa maassa asuu pieni iloinen tomaatti nimeltä Tomaatti. Eräänä päivänä sankarimme päätti käydä kaukaisten sukulaistensa luona. Tätä varten hänen on ajettava tietä tietä. Sinä pelissä Tomato Runner autat häntä pääsemään matkansa loppupisteeseen. Sankarimme matkalla törmää maan pintaan, esteisiin ja pieniin jokiin. Sinun on napsautettava näyttöä saadaksesi hänet hyppäämään ja lentämään siten näiden vaarallisten tieosien yli. Matkalla hänen on kerättävä erilaisia u200bu200besineitä ja kolikoita.