Aktiviteetin mukaan mystisen tutkintatoimiston jäsenet, joissa Scooby-Doo ei ole viimeinen, ovat eri paikoissa. Useimmiten ne ovat vaarallisia ja joutuvat jopa riskittämään henkensä. Pelissä Scooby-Doo! Ylilaivalla mennät merirosvolaivojen sankarien mukana. Itse merirosvot ovat ristiriitaisia u200bu200bmiehiä, ja sitten he vain pääsivät erimielisyyteen ja aluksen kuohunta alkoi. Joukkue jaettiin kahteen osaan, jotka sijaitsevat kannen vastakkaisissa päissä. He ampuvat aseita, heittävät sabeita ja muita vaarallisia esineitä. Tällaisessa tilanteessa sinun on autettava Scoobya pääsemään kannen yli.