Kerran rauhallisella valtameren saarella, jossa asuivat hyvät apinat, orangut merirosvolaivat purjehtivat ja vangitsivat saaren ajaen paikalliset asukkaat mereen. Apinat olivat aluksi hyvin järkyttyneitä, mutta sitten he kokoontuivat ja päättivät palauttaa alkuperäisen maansa takaisin. He rakensivat aluksia itselleen, varustivat ne aseilla ja nostivat merirosvolipun. Nyt he eivät ole vaarattomia makakkeja, vaan vaarallisia merirosvoja ja ovat valmiita rankaisemaan rikoksentekijöitä. Ohjaa aluksia entisen kotisaaren rannoille sieppaamaan sieltä hyökkääjät. Taistele vihollisia vastaan, täydentämällä joukkueesi jatkuvasti uusilla taistelijoilla ja antamalla määräajoin volley-aseita Chimps Ahoyssa!