Kaukaisessa ihmeellisessä maailmassa olennot, kuten Pokemon, asuvat ihmisten kanssa. Jokaisella heistä on tiettyjä maagisia kykyjä. Tänään, uudessa Pokémon Clover -pelissä, sinä ja yksi Pokémonista päätitte tutkia metsää. Ennen kuin näytöllä näet hahmosi, jotka liikkuvat metsäpolkua pitkin. Heidän on kerättävä kasvi, kuten apila, jolla on legendan mukaan maagisia ominaisuuksia. Tässä heitä estävät erilaiset hirviöt. Sinun on käytettävä ohjauspaneelia Pokemon-toimintojen ohjaamiseen. Ohjauksessasi hän käyttää erilaisia taikahyökkäyksiä ja tuhoaa vihollisen.