Luonnossa tapahtuu jatkuvasti jotain, elävät olennot ja kasvit kehittyvät ympäröivän maailman muutoksista riippuen. Evoluutio etenee hitaasti, vähitellen eikä vuosia, vaan vuosisatoja. Mutta Evolution Simulator 3D -pelissä voit nopeuttaa kaikkea merkittävästi. Aluksi luot hyönteisen, jota hallitset. Kun olet muodostanut kuvan, lähde matkalle. Kerää syötäviä kasveja ja sieniä, hedelmiä ja niin edelleen kasvaa ja kehittyä. Lisäksi voit jopa hyökätä muihin hyönteisiin, mutta niiden on oltava kooltaan paljon pienempiä Evolution Simulator 3D:ssä.