Gnasty Gnork on hyökännyt Dragon Kingdomiin. Hyökkäys oli niin odottamaton, että lohikäärmeillä ei ollut aikaa tulla järkiinsä, kun ne muuttuivat kivipatsaiksi. Vain Spyro selvisi hengissä, hän on pienikokoinen ja hänen maagiset iskunsa eivät saavuttaneet häntä Spyro the Dragonissa. Nyt hänen on pelastettava kaikki sukulaisensa ja ystävänsä sekä voitettava Gnork, koska pelastetut eivät auta häntä. Taikuudelle altistumisen jälkeen he ovat edelleen heikkoja, vaikka he olisivat heittäneet pois kivivaatteensa. Mutta pieni keiju auttaa sankaria eikä näytä siltä, että hän on miniatyyri, Vedas-lohikäärme ei myöskään ole jättiläinen, mutta yhdessä he tekevät suuria asioita, ja sinä autat heitä Spyro the Dragonissa.