Kuplat ovat ympäröineet jokaista hedelmää ja aikovat vetää ne jonnekin ylös Fruit Bubbleen. Sinun on estettävä rohkea varkaus. Ammu kuplia ja yritä kerätä kolme identtistä hedelmää vierekkäin. Kuplat puhkeavat sellaisesta naapurustosta ja hedelmät putoavat alas painovoimalain ansiosta. Jokaisen tason tehtävänä on tuhota kaikki kuplat ja tyhjentää pelikenttä kokonaan. Ammu hedelmiä, seuraava hedelmä näkyy vasemmassa alakulmassa, jolloin voit suunnitella toimiasi. Tasoilla aika on rajallinen, Fruit Bubble -pelissä on satakaksikymmentä värikästä ja jännittävää pulmaa.