Kaukana avaruudessa, jonkin planeetan kiertoradalla, oli avaruusalus, johon oli olemassa laboratorio, jossa tehtiin kokeita eri eläimillä. Heidät injektoitiin vieraiden DNA: n kanssa ja katselivat, kun he muuttuivat. Kuten tukikohdassa, yhteys katosi ja sotilaat lähetettiin sinne Star Assaultilta. Meillä on yksi heistä Mothershipin hyökkäyksessä. Meidän hahmomme on varustettu tavallisilla ampumatarvikkeilla. Hänen tehtävänsä on tunkeutua alukseen ja selvittää, mitä siellä tapahtui. Kun kävi ilmi, koko miehistö muuttui hirviöiksi ja nyt sinun täytyy tulla taistelemaan heidän kanssaan. Käyttämällä aseita sinun on nopeasti ja tehokkaasti tuhottava kaikki hirviöt, joita kohtaat aluksen kannella.
