Pelissä Ninja Monster Killer matkamme muinaiseen Japaniin. Keskiajalla ihmiset, joilla oli maagisia voimia, asuivat täällä. Jotkut heistä käyttivät voimiaan vahingoittaa ihmisiä. Yksi tällainen taikuri, taikuuden ja kokeiden kautta, keräsi hirviöitä, joita hallitsi erityinen artefakti. Yksi rohkea ninja sai käskyn varastaa esinettä. Nyt hänen tulee mennä linnaan, joka seisoo vuorella ja varastaa kohteen. Sankarimme polku sijaitsee viereillä, jotka johtavat vuoren huipulle. He ovat hirviöitä. Sinä hallitset sankaria on hypätä heitä eteenpäin.
