Pieni vihreä ulkomaalainen, joka matkusti galaksin ympärille löytääkseen uusia planeettoja, putosi anomaliaan. Nyt sinun tulee pelata Aliens Bubble Shooter -pelaajaa auttamaan häntä pelastamaan elämänsä ja säilyttämään aluksen eheyden. Hahmosi näkee esteen moniväristen tehomullien muodossa, jotka liikkuvat hänen aluksensa suuntaan. Sinun täytyy tuhota ne ja tyhjentää tie. Tätä varten käytät ilmatäytteistä erityistä kuoret. Niillä on myös väri. Kun ammus osuu tiettyyn väriin täsmälleen samoissa väripalloissa, räjäytät ne ja saat pisteitä.