Velhojen oppilaan Tomin on tänään autettava opettajaansa luomaan erilaisia u200bu200bhirviöitä. Sinä pelissä Monster Merge liittyt hänen kokemuksiinsa. Ennen kuin näet näytön, näet maan pinnan jakautuneen yhtä suureen määrään soluja. Heihin ilmestyy erityyppisiä ja värejä hirviöitä. Tutkittuaan huolellisesti kaiken, sinun on löydettävä kaksi identtistä olentoa. Sitten yhdistät ne linjaan käyttämällä erityisiä ohjausnuolia. Sitten ne sulautuvat, ja saat uudenlaisen olennon.