Vuoden 2020 pandemia halvasi elämän kaikilla mantereilla. Ihmiskunnan ei ole vielä tarvinnut kestää sellaista koetta, mutta ihmiset selviävät, ja sinä autat heitä virtuaalikentällä. Jos todellisuudessa virus on näkymätön, mutta Covid Killissä voimme nähdä sen salakavalan persoonallisuuden täydellisesti. Sankarimme on aseistettu erityisillä antiseptisillä aseilla, jotka ampuvat desinfiointiaineella. He tappavat pahan viruksen hirviöt paikan päällä, ja lopuksi taistelevat virusten pääpomoksi ja tuhoavat hänet kokonaan. Käy läpi kaksikymmentä tasoa ja virus hävitetään.