Osana pikselisoturien ryhmää löydät itsesi hylätystä tehtaasta osallistumaan seuraaviin sotilaallisiin taisteluihin nimeltä Pixel Factory Battle 3D. Toverisi merkitään punaisilla merkinnöillä heidän päänsä yläpuolella. Tämä antaa sinulle mahdollisuuden navigoida nopeasti etkä aloita ampumista yksin. Etsi vastustajia, joilla on muita värimerkkejä, ja älä sitten haukottele, ammu tappaaksesi, muuten ne tuhoavat taistelijasi. Tämä on joukkuepeli, joten sinun tulee vakuuttaa ryhmäsi jäsenille tarvittaessa myös he tukevat sinua ja eivät anna sinun lyödä takaapäin, mikä on erittäin tärkeää.