Pienessä amerikkalaisessa kaupungissa on avattu uusi klinikka, joka hoitaa erilaisia lemmikkejä. Uudessa Doctor Pets -pelissä työskentelet lääkärinä. Sairaalan aula ilmestyy näyttöön edessäsi, jossa potilaasi sijaitsevat. Sinun on valittava eläin hiiren napsautuksella. Sen jälkeen sinä ja potilas löydätte itsesi toimistosta. Ensinnäkin sinun on tutkittava potilas ja diagnosoitava hänet käyttämällä erilaisia lääkinnällisiä instrumentteja. Sen jälkeen sinun on aloitettava hoito. Jos sinulla on vaikeuksia pelissä, on apua. Hän näyttää sinulle toimintasi järjestyksen ja käyttämäsi huumeet. Kun olet tehnyt kaikki käsittelyt, potilas on terve ja voit aloittaa seuraavan eläimen hoidon.
