Pixelmon-niminen olento asuu Minecraft-maailmassa. Jotenkin sankarimme meni maan syrjäisimmille alueille asettumaan tänne ja rakentamaan pienen kaupungin. Sinä Pixelmon Craft -pelissä autat häntä tässä. Näytölläsi edessäsi näet hahmosi, joka on tietyssä paikassa. Sen sivulla on pieni kartta, jossa on kuvakkeita, jotka osoittavat eri resurssien sijainnin. Sankarisi täytyy käydä kaikissa näissä paikoissa ja hankkia nämä resurssit. Sitten, käyttämällä erityistä ohjauspaneelia, aloitat erilaisten rakennusten rakentamisen sankarimme tarpeisiin. Voit myös luoda uusia työkaluja ja aseita.
