Meri-valtakunnassa syttyi sota kahden valtaistuimen teeskentelijän välillä. Vihamielisyyksien aikana molemmat osapuolet käyttävät taistelukalojen erikoiskoulutettuja osia. BattleFish-pelissä liityt yhteen osapuoliin ja käsket yhtä kalaryhmistä. Tietyt veden alla olevat sijainnit näkyvät edessäsi olevalla näytöllä. Toisella puolella on taistelukalasi ja vihollisen toisella puolella. Alareunassa on erityinen ohjauspaneeli, jossa on kuvakkeet. Heidän avustuksella ohjaat joukkueesi toimintaa. Sinun tulee tutkia viholliskala huolellisesti ja valita kohde hyökätäksesi siihen. Kalasi iskevät ja tuhoavat vihollisen yhdessä. Tästä saat pisteitä.
