Doctor Teeth 3 -pelin kolmannessa osassa jatkat työskentelyä hammaslääkärinä klinikalla. Tänään useat lapsipotilaat tulevat tapaamaan sinua. Kun olet valinnut potilaan, löydät itsesi toimistostasi. Lapsi istuu edessäsi tuolilla suu auki. Ensinnäkin sinun on tutkittava hänen suuontelonsa erittäin huolellisesti ja tehtävä diagnoosi. Sen jälkeen aloitat hoidon. Tätä varten sinun on käytettävä tiettyjä hammaslääketieteellisiä instrumentteja ja lääkkeitä. Mitä tahansa olet onnistunut pelissä, on apua. Toimintasi järjestys ilmoitetaan sinulle vihjeiden muodossa. Kun olet valmis, potilas on terve ja voit jatkaa seuraavaan hoitoon.