Muukalaiset hirviöt hyökkäsivät lohkoiseen neonkaupunkiin. He hyökkäsivät niin odottamatta, että kenelläkään ei ollut aikaa orientoitua ja järjestää puolustusta. Mutta Battle Cubes 3D -pelin sankari oli hereillä. Hän on sotilas ja aseet ovat aina mukanaan, mikä tarkoittaa, että taistelu tulee olemaan. Kukaan ei auta häntä, hänen on taisteltava pienten, mutta erittäin pahojen olentojen hyökkäyksiä vastaan yksin. He ympäröivät kaikilta puolilta ja tehtävänä on tuhota kaikki viholliset ja estää heitä upottamasta hampaitaan lihaan. Kun hyökkäykset torjutaan, voit ostaa ja vaihtaa aseita tehokkaampiin aseisiin, joilla on suuri tuhosäde Battle Cubes 3D:ssä.
