Samurait ovat sotureita ja heidän on oltava aina erinomaisessa fyysisessä kunnossa, joten päivittäinen harjoittelu on välttämätöntä. Pelissä Samurai Jump autat samuraita läpäisemään vaikean testin, jonka hän itse keksi. Hän juoksee ylös rinnakkaisiin seiniin hyppäämällä vasemmalle tai oikealle matkalla ilmenevistä uhista riippuen. Se voi olla valtava pyörösaha, jota vastaan ei ole pakoa, jos et lähde. Hyppääessäsi yritä saada kiinni hedelmiä ja sydämiä täydentääksesi ihmishenkien määrää. Jos kaikki on käytetty loppuun, Samurai Jump -peli päättyy ja myös harjoitus päättyy.