Planeetalla on yhä vähemmän valkoisia täpliä ja suurin osa niistä sijaitsee valtamerien alueella. Meren syvyydet kätkevät sellaisia salaisuuksia, joita emme edes epäile. Tarvitset erikoisvarusteita päästäksesi niihin. Ja joitain syvyyksiä on yksinkertaisesti mahdotonta tutkia, koska ihmiskunta ei ole keksinyt, kuinka sinne pääsee. Tiede ei kuitenkaan pysähdy ja ihminen syvenee vähitellen, mutta toistaiseksi rohkeat sukeltajat käyttävät sitä mitä on tarjolla. Pelissä Sunken Civilization tapaat sankarittaren nimeltä Susan. Hän on kokenut sukeltaja ja on tutkinut merenpohjaa pitkään. Äskettäin hänen tutkimuksensa onnistui, hän löysi uponneen kaupungin, muinaisen sivilisaation jäänteet. Liity sankarittaren joukkoon ja tutki Uponneen sivilisaation vedenalaisia raunioita.
