Squid-peliä pelataan syrjäisellä saarella, eikä lehdistö ja televisio käsittele sitä, joten suuri yleisö ei tiedä, mitä siellä tapahtuu. Mutta silti jotain tietoa saapuu ja ne ovat häiritseviä. Näyttää siltä, että peli ei ole täydellinen ilman uhreja, ja tämä on ehdottomasti selvitettävä. Squid Operator Hunt -pelissä sinä salaisena agenttina tunkeudut pelialueelle ja selvität tilannetta. Sinun on osallistuttava tulitaisteluun ja tuhottava sotilaat punaisissa haalareissa, et missaa heitä mistään. Lisäksi jokaisen tason suorittamisen tavoitteena on tuhota tietty määrä sotilaita Squid Operator Huntissa.
