Shogun Showdownin shogunilla on monia vihollisia, joten hän tarvitsee apua älykkäältä strategilta ja taktikolle. Sinusta voi tulla yksi. Viholliset, joilla on eri tasoinen koulutus ja voima, hyökkäävät samuraita vastaan. Sankarisi osaa yhtä hyvin käyttää sekä miekkaa että jousta. Yhdessä tapauksessa on järkevämpää käyttää nuolia ja toisessa miekkaa. Sinun on päätettävä, minkä kanssa soturisi taistelee, ja hänen voittonsa tai tappionsa riippuu tästä. On mahdollisuus parantaa taitojasi, ja tämä on väistämätöntä, koska vihollinen vahvistuu ja häntä on mahdotonta vastustaa Shogun Showdownin vanhoissa olosuhteissa.
