Uudessa Pen Boy Runner -pelissä sinun on autettava punaista kynää kulkemaan tiettyä reittiä ja pääsemään matkasi päätepisteeseen. Ennen kuin olet näytöllä, näkyy tietylle alueelle, jolla kynä sijaitsee. Ohjausnäppäimillä ohjaat hänen toimintaansa. Paikan ympärille on hajallaan erilaisia esineitä, jotka toimivat esteinä. Kahvasta poistut katkoviivan sijainnista. Se kertoo reitin, jota pitkin kynäsi liikkuu. Kun olet kulkenut sen läpi ja kerännyt tiettyjä esineitä matkan varrella, löydät itsesi maaliin. Heti kun kahva ylittää sen, saat pisteitä ja siirryt pelin seuraavalle tasolle.