Kioton urhean ninjan täytyy hänen ritarikuntansa päällikön ohjeiden mukaan mennä pimeille maille ja löytää sieltä muinaisia esineitä. Sinä pelissä Ninja vs Zombies liität hänen kanssaan tähän seikkailuun. Sankarisi täytyy käydä läpi monia paikkoja ja voitettava erilaisia vaaroja. Zombilaumot vaeltavat paikoissa, joita vastaan sankarisi joutuu taistelemaan. Taistelemaan heidän kanssaan sankari käyttää erilaisia aseita. Tuhoamalla eläviä kuolleita ansaitset pisteitä, ja voit myös kerätä niistä putoavia palkintoja. Saamillasi pisteillä voit ostaa erilaisia aseita ja ammuksia hahmollesi pelikaupasta.
