Monimutkaisiin ja vastuullisiin tehtäviin, kun tarpeetonta melua ei voida luoda, nimitetään agentit, joilla on erityisiä taitoja ja kykyjä. Sellainen pelissä Stealth Master 3D on sankarimme. Hän yrittää olla käyttämättä pienaseita, mutta pärjää sapelilla, veitsillä, miekoilla toimiakseen hiljaa kiinnittämättä huomiota. Ennen jokaista tasoa saat tehtävän ja sinun on suoritettava se saadaksesi uuden. Tämän tason agenttia ei pidä erehtyä. Lippaa huoneeseen, lähesty tietämätöntä vihollista ja iske. Jos se kääntyy ympäri ja sankarisi on punaisen säteen alueella, tehtävä epäonnistuu Stealth Master 3D:ssä.
