Flip Ninjassa ei näytä olevan painovoimaa ninjoille. Hän voi hypätä ylös ja sitten pudota alas samalla ketteryydellä seisoen aina lujasti molemmilla jaloillaan. Siksi itse hyppääminen ei ole hänelle ongelma, mutta avaruudessa olevasta tulee testi. Terävät shurikenit ja muut lävistävät ja leikkaavat esineet lentävät ulos vasemmalta ja oikealta. Sinun on valittava hetki, jolloin polku on vapaa, ja vasta sitten hypätä. Jokaisesta onnistuneesta hypystä saat yhden pisteen, ja jos onnistut nappaamaan hedelmän: punaisen tai vihreän, saat kolme pistettä kerralla Flip Ninjassa.
