Nykyisissä sodissa painopiste on nykytekniikassa ja eri kantomatkan ohjukset ovat erityisen arvokkaita. Niistä on tulossa tarkempia ja tuhoisampia, ja sinun on ohjattava joitain Boom Missile 3D:n ohjuksia. Tehtävänä on osua kohteeseen saarella. Tiedustelupalvelu ilmoitti, ja partisaanit korjasivat kohdetta. Sinun tarvitsee vain kohdistaa ohjus ja ohjata sitä, sillä vihollinen yrittää ampua sen alas millä tahansa keinolla. Kaikki, mikä lentää sinua kohti, on uhkaa, jopa vaarattomat ilmapallot. Väistä ja liiku kohti kohdetta, kunnes iso bada-buumi tapahtuu. Jokaisella tasolla osut eritasoisiin kohteisiin Boom Missile 3D:ssä.