Ihmiset uskovat ylimielisesti tietävänsä kaiken ja tämän luottamuksen juurruttavat heihin tieteen kehitys ja lukuisten löytöjen ja keksintöjen syntyminen. Tämä ei kuitenkaan pidä paikkaansa, ja todella viisaat ihmiset luottavat siihen, että ihmiskunta on vasta todellisten löytöjen partaalla. Mutta Hidden Village -pelissä emme puhu sellaisista globaaleista asioista, vaan suloisesta tytöstä nimeltä Emma. Hän on älykäs yli vuosien ja uskoo taikuuden olemassaoloon, mikä tarkoittaa, että sadut ja legendat eivät ole fiktiota. Tyttöä kylässä pidetään outona, mutta hän ei aio muuttua miellyttääkseen yleistä mielipidettä. Päinvastoin, sankaritar lähtee etsimään kadonnutta kylää, jossa legendan mukaan asui ihmisiä, joilla oli maagisia voimia. Auta Emmaa löytämään kylä Hidden Villagessa.
