Tietty ohjelma hyvin todellisen olennon persoonassa, joka on ulkoisesti samanlainen kuin ihminen, haluaa poistua digitaalisesta matriisista, ja syynä on se, että se tuhotaan Matrix Escapessa. Sankari haluaa löytää ns. takaoven ja tehdäkseen tämän hänen täytyy liikkua hyvin nopeasti. Matrix on päättäväinen, se yrittää katkaista kaikki polut. Kaikki mihin voit luottaa, katoaa silmänräpäyksessä, joten et voi viipyä edes sekunnin murto-osaa, vaan liikkua jatkuvasti eteenpäin hyppäämällä lohkosta toiseen. Tarvitset Matrix Escapessa kätevyyttä, ketteryyttä ja nopeaa reagointia.
