Ystävät Zoro ja Luffy haluavat löytää One Piece -aarteen tullakseen kuuluisimmiksi merirosvoiksi, ja Luffy haluaa tulla heidän kuninkaansa. Sillä välin hän johtaa pientä Straw Hat -merirosvoryhmää, jota vakavat merirosvot eivät pidä kilpailijoina. Pelissä One Piece Pirate Battle sankarit tutkivat Grand Line -saarta eivätkä välttele seikkailuja. Ei vain merirosvot, vaan myös hallitus jahtaavat aarretta. Se ei ole kiinnostunut meriryöstöjen vahvistamisesta. Siksi sankarit joutuvat taistelemaan sekä kuninkaallista armeijaa että roistoja ja rosvoja vastaan One Piece Pirate Battlessa. Kaksi ihmistä voi pelata.
