Eritasoiset taikurit, velhot, velhot ja jopa noidat käyttävät erityisiä maagisia palloja, joissa he näkevät tulevaisuuden tai menneisyyden. Jokainen pallo voi suorittaa tietyn toiminnon. Lisäksi palloja on eri tasoisia ja tasakokoisia. Peli 3D Balls: Merge kutsuu sinut vierailemaan paikkaan, jossa taikapallot muodostuvat, tähän paikkaan pääsevät vain korkeat taikurit ja nyt myös sinä. Pallot putoavat alas käskystäsi, joten varmistat, että kaksi identtistä palloa törmäävät. Tämän seurauksena fuusio tapahtuu ja halkaisijaltaan suurempi ja korkeampi pallo ilmestyy 3D Balls: Merge -sovellukseen.
