Tiedemiehet ympäri maailmaa, jokainen omalla alallaan, työskentelevät väsymättä tehdäkseen suuren löydön. Kuitenkin vain harvat onnistuvat; useimmat tutkimukset ovat kesken. Niiden rahoitus suljetaan mahdollisuuksien puutteen tai kokeilujen epäonnistumisen vuoksi. Pelin Library Mysteries sankarittaret ovat yhden kuuluisan yliopiston opiskelijoita. Amelia, Candace ja Ava ovat intohimoisia tieteelle ja haluavat tulla kuuluisiksi. He saivat tietää, että yksi heidän laitoksensa professoreista oli mukana vakavassa tieteellisessä kehityksessä, mutta projekti suljettiin ja professori katosi. Tytöt haluaisivat löytää hänen teoksiaan yliopiston kirjastosta ja tutkia niitä. Auta tyttöjä kirjaston mysteereissä.
