Ninja Assassinissa sankarisi on murhaaja ninja ja hän tekee työnsä apuasi. Se koostuu niiden vihollistensa tukemisesta. Itse asiassa tehtävänä on puhdistaa varastot. Heille odotetaan suurta hyökkäystä ryöstää. Vartijat kävelevät huoneiden ympäri laatikoilla, valaiseen tiensä lyhtyillä. Jos ninja on vyöhykkeellä, jota lyhty valaisee, vartija näkee hänet ja hyökkää häntä. Sinun tulisi valita pimeältä puolelta ja hyökätä heti. Koko prosessi on hiljaa, jotta muut vartijat eivät ole varovaisia Ninja Assassinissa.
