Diego lähti toiselle tutkimusmatkalle ja tällä kertaa hän halusi ratkaista atsteekkien pyramidien arvoituksen. Pelissä Go Diego Go! Diego's Puzzle Pyramid voit liittyä sankariin. Hän onnistui löytämään salaisen käytävän yhteen pyramidista, mutta se suljettiin kerroksilla monivärisiä lohkoja. Siirron avaamiseksi sinun on poistettava kaikki lohkot kentältä kullakin tasolla napsauttamalla kahden tai useamman samanvärisiä ryhmiä, jotka sijaitsevat vierekkäin Go Diego Go! Diegon palapelipyramidi. Yritä olla jättämättä yksittäisiä lohkoja, niiden poistaminen johtaa pisteiden menettämiseen, ja ne kerääntyvät pussiin Diegon pään yläpuolelle.