Kingdom of Ninja -pelissä menet valtakuntaan, jossa ninjasoturit asuvat. Viime vuosina on ollut huonot sääolosuhteet ja sato on ollut hyvin vähäistä, ja myös verenhimoisia hirviöitä on alkanut ilmaantua. Kuningas itse päätti korjata tilanteen, koska hän on vastuussa asukkaidensa elämästä. Tätä varten hänen on mentävä alas kaupungin alle oleviin katakombeihin, koska sieltä pimeyden olennot alkoivat ilmestyä yöllä. Lisäksi hän luki muinaisista kääröistä, että näihin labyrinteihin oli kätketty muinaisia aarteita, ja jos ne kerättäisiin kaikki, paha loitsu kariutuisi. Seuraat sankarisi, joka näyttää mustalta neliöltä, jonka silmissä on punainen raita. Täyttääkseen kaikki muinaisten kronikoiden ehdot hänen on mentävä maan alle aseettomana, ja vain uskomaton näppäryys auttaa häntä läpäisemään kaikki testit. Ensimmäisestä askeleesta lähtien hän joutuu kohtaamaan erilaisia ansoja, reikiä maassa ja korkeita reunuksia. Joissain paikoissa sinun on kiivettävä seiniin päästäksesi seuraavaan kerrokseen. Jos tapaat hirviöitä matkan varrella, sinun ei pitäisi yrittää hyökätä heidän kimppuunsa, koska taistelua ei ole mahdollista voittaa. On parempi vain hypätä yli ja jatkaa aarrearkkujen etsimistä Kingdom of Ninjasta.