Jokaisella avaruusaluksen ohjaajalla on oltava tiettyjä ohjaustaitoja. Siksi kaikki heidät on koulutettu erityiskouluissa. Yksi koulutuksen lentotyypeistä on simulaattoreita. Tänään pelissä Missile Game 3D yrität käydä läpi yhden niistä. Istut aluksen ohjaushyttiin, joka lentää tiettyä reittiä pitkin. Jotkut sinun täytyy vain lentää. Toisissa kohdissa tulee olemaan tiettyjä kohtia, joihin sinun on lähetettävä aluksenne lentämään niiden läpi.
