Hämähäkkimiehellä on joskus tapahtunut epätavallisia asioita, etenkin viime aikoina. Hän voi mennä nukkumaan kotonaan ja herätä aivan eri paikassa. Tämä on jonkinlaista taikuutta tai supertekniikkaa, sinun on selvitettävä se ennen kuin se pahenee. Pelissä Marvel Ultimate Spider-Man Mystery City sinä ja supersankari löydät itsesi salaperäisestä kaupungista, jota ei ole kartalla. Todennäköisesti hän on rinnakkaisuniversumissa. Hämähäkkimies haluaa ymmärtää, miten hänet kuljetetaan avaruudessa ja miksi juuri täällä. Liikkumaan kaupungissa. On tarpeen hypätä ja laskeutua täsmälleen sinisille laattoille, muuten sankari voi loukkaantua Marvel Ultimate Spider-man Mystery Cityssä.