Kaukaisessa ihmeellisessä maailmassa elävät älykkäät hedelmät. Kuten sinä ja minä, he rakastavat urheilua ja järjestävät usein erilaisia kilpailuja. Hahmosi Vesimeloni, joka osallistuu juoksukilpailuihin. Pelissä Watermelon Run 3d autat häntä voittamaan ne. Ennen kuin olet näytöllä, näet hahmosi, joka nopeuttaa vähitellen juoksumatolla juoksemista. Käyttämällä ohjausnäppäimiä sinun on saatava vesimeloni juoksemaan sen tiellä olevien esteiden ympäri. Lisäksi sankarisi joutuu hyppäämään rei'ien yli maassa ja muilla vaarallisilla alueilla matkallaan. Erilaisia hedelmiä hajallaan tiellä, ja sinun on autettava Vesimelonia keräämään ja saamaan siitä pisteitä.
