Elävien kuolleiden armeija hyökkäsi kasvien valtakuntaan. Kun se kulkee tietä kohti pääkaupunkia, se tuhoaa kaiken tiellään. Pelissä Plants vs Zombies TD ohjaat pääkaupungin puolustusta. Tietty alue näkyy edessäsi olevassa näytössä. Sinun on tunnistettava strategisesti tärkeät paikat. Sen jälkeen voit rakentaa näihin paikkoihin puolustusrakenteita käyttämällä erityistä ohjauspaneelia ja nostaa kukkasotilaita. Kun zombeja pääsee lähelle, kasvit avaavat tulen ja tuhoavat vihollisen. Jokaisesta tapetusta zombista saat pisteitä.