Ninja päätti jälleen kerran juosta Ninja Samurai Runnerin pysyäkseen kunnossa niin kauan kuin konflikteja ei esiinny eikä taistelulajien taitojaan näy missään. Mutta hänen juoksunsa ei ole vain harjoittelua, hän menee paikkoihin. Mistä löydän pokaalikultaa: kolikoita, sormuksia, harvinaisia keltaisia kiteitä. Missä on jotain arvokasta, siellä täytyy olla jonkinlainen saalis, ja tämä on totta. Sankarin on oltava varovainen, koska kullan vieressä voi olla räjähteitä. Kun hyppäät tasoille, laske kantama, jotta et aktivoi pommia Ninja Samurai Runnerissa.