Boboboy-niminen kaveri matkustaa galaksin eri planeetoille ja taistelee erilaisia roistoja vastaan. Sinä pelissä Boboiboy Galaxy Run autat hahmoa tässä seikkailussa. Edessäsi hahmosi näkyy näytöllä, joka sijaitsee tietyssä paikassa. Ohjausnäppäimillä ohjaat hänen toimiaan. Sankarisi joutuu juoksemaan eteenpäin planeetan pinnalla asteittain nopeutuen. Hänen matkallaan tulee maasta esiin työntyviä piikkejä, notkahduksia ja muita vaaroja. Saat sankarin hyppäämään ja lentää ilmassa kaikkien näiden vaarojen läpi. Kun olet tavannut vihollisen, ammut häntä kohti tulihyytymiä. Siten tuhoat vastustajat ja saat siitä pisteitä. Auta myös kaveria keräämään erilaisia hyödyllisiä esineitä, jotka ovat hajallaan hänen polullaan.
