Useita astronauteja valmistautuu avaruuteen lentämään kerralla. Päämiehistöllä on varmuuskopiot äkillisen sairauden tai odottamattomien tilanteiden varalta. Pelin Astronaut Run 3D sankari on yksi näistä tuplaisista, mutta hän todella haluaa lentää. Hän harjoitteli pitkään, valmistautui, ja tänään hänellä on viimeinen mahdollisuus osoittaa kaikki saamansa taidot tullakseen valituksi, ei kilpailijansa. Hakijan tulee suorittaa matka useassa vaiheessa täydessä astronauttiasussa, esteet ohittaen ja kaikki tilaisuudet hyväkseen. Nopeuta juoksuasi muuttamalla se lennosta. Auta sankaria Astronaut Run 3D:ssä.
