Halloweenin aattona toinen maailma aktivoituu ja jopa sellainen sankaritar kuin noita, joka ei pelkää pahoja henkiä, tulee levottomaksi. Pelissä Run Witch Run autat nuorta satavuotiasta noitaa, joka päätti mennä halloween-aattona yöksi metsän pimeimpään metsään. Sankaritar ottaa riskejä tietoisesti, hän tarvitsee kiireesti makeisia, hänellä ei ollut aikaa valmistaa herkkuja eikä hänellä ole mitään, millä hemmottelee vieraita. Mutta maagisessa lehdossa karkkia roikkuu ilmassa, kerää vain ne. Vaaralliset olennot yrittävät kuitenkin pysäyttää noidan. Hyppää niiden yli Run Witch Runissa.
