Escape the Giant School 3D -pelin sankarista tuli yhtäkkiä hyvin pieni ja hän joutui kouluun, josta oli tullut hänelle jättimäinen. Tavalliset kirjat, lyijykynät ja pyyhekumi ovat muuttuneet esteiksi pojan tielle ja hän haluaa nopeasti poistua vaaralliseksi muuttuneesta koulusta. Auta häntä voittamaan esteet valtavien paperitavaroiden, oppikirjojen ja muiden oppilaiden yleensä käyttämien esineiden muodossa. Hyppää yli pyyhekumien ja lyijykynien, yli kirjojen ja kirjoituspöydän ja saavuta maaliviivan siirtyäksesi uuteen paikkaan Escape the Giant School 3D:ssä.
