Half Life 2 Platformerissa tapaat taas Gordon Freemanin. On kulunut useita vuosia onnettomuudesta salaisessa laboratoriossa tehdyn kokeen aikana, sankari oli pysähtyneessä tilassa, josta salaperäinen Jemen toi hänet ulos. Herätessään sankari huomasi, että Alliance - planeettojenvälinen imperiumi - oli vanginnut maailman, joka tuhosi hirviöitä Zen-planeetalta, mutta valloitti planeetan. Gordon aikoo taistella hyökkääjiä vastaan, mutta hän tarvitsee liittolaisia. Half Life 2 Platformerissa autat sankaria pääsemään tielle liikkumalla ja taistelemalla Alliancen sotilaita vastaan käyttämällä konepistoolia, painovoimapistoolia ja jopa sorkkarautaa lähitaistelussa.