Eräänä aamuna Mario heräsi siihen, että jokin esti häntä makaamasta selällään. Löydessään joitain kasvaimia hän oli melko peloissaan ja tuli heti järkiinsä pelosta ja juoksi peiliin katsomaan. Mitä sen takana näkyi. Nähdessään pienet siivet sankari hämmästyi ja jopa järkyttyi Flappy Mariossa. Mutta sitten pohdittuaan hän päätti, että kyky lentää antaisi hänelle paljon etuja. Hänen ei enää tarvitse huolehtia kuljetuksista, hän voi ylittää polun ilmassa paljon nopeammin kuin moottoripyörällä tai autolla. On vain opittava lentämään, ja autat häntä tässä siirtymällä Flappy Mario -peliin.